细胞凋亡前中期会出现细胞膜和细胞质的变化，晚期则细胞核内DNA会出现损伤和断裂，因此可以通过检测DNA的断裂从而反应细胞的凋亡情况。
一、彗星实验
实验原理：
当各种内源性和外源性因素诱发细胞DNA链断裂时，其超螺旋结构受到破坏，在细胞裂解液作用下，细胞膜、核膜等膜结构受到破坏，细胞内的蛋白质、RNA以及其他成分均扩散到电解液中，而核DNA由于分子量太大不能进入凝胶而留在原位。
检测方法：
中性处理：在中性条件下，DNA维持双链构象，因而仅可以检测双链断裂。
碱性处理：在碱性电解质的作用下，DNA发生解螺旋，损伤的DNA断链及片段被释放出来。由于这些DNA的相对分子质量小且碱变性为单链，所以在电泳过程中带负电荷的DNA会离开核DNA向正极迁移形成彗星状图像。
实验操作：
将细胞固定于低熔点琼脂糖中；
用裂解液破坏细胞膜；
再用碱溶液使 DNA 分子解旋；
将载玻片置于电泳液中，在电场的作用下，DNA 分子向阳极移动。
实验结果分析：
如果 DNA 损伤严重，则产生的碎片就越多、越�。蜓艏ㄒ频腄NA碎片量就越多，迁移距离也越长，荧光染色后就能看见“彗星”样尾长并且荧光强度增强。
未受损伤的 DNA 大分子则由于细胞膜的阻隔，滞留在原处。
二、实验数据分析
数据处理（以CASP彗星分析软为例）
（1）在拍照时以tif格式保存图片，然后点击下图的绿色框选的位置导入文件。
（2）打开view下拉菜单，选“resultwindow”，在分析后您就可以看到您的结果窗口。
分析之前最好把右侧的head和tail选中，（红色框选部分，这样可以出现头、尾分明的视觉效果，如图Fig2）
（3）用白色画框选中要分析的区域（见Fig3）
（4）图中数字表示
1：翻页
2：分析
3：保存
4：调整背景调整
5：进入正式分析
调整好位置后，开始分析前要点击“5”，然后点“ 2”，再点“ 3 ”，这样一张图的数据就分析完了，数据会保存在系统里。点击“翻页”可以继续分析下一张图。
绿色框选所指区域是分析后的曲线，主曲线图下面列举了几个数据，全部结果在结果窗口。
（5）将分析窗口最小化（点击下图红色框选部分）可以预览分析好的数据
（6）分析完所有图片后导出数据保存成txt格式，保留TailDNA%（尾部DNA百分含量），TailLength（尾长），TailMoment（尾矩）三列数据，下图为细胞展示图。
7）根据彗星尾部荧光强度占总强度的百分比（TailDNA%）将采集的细胞图像分为5个等级。
